C’est la rentrée pour Cyrus, Léo et Némo. Ces trois Mousqueterribles sont ravis à l’idée de retrouver leur maîtresse Anne qu’ils adorent faire tourner en bourrique.
Mais celle-ci est aux abonnés absents et c’est monsieur Schmidt qui la remplace. Le maître refuse de leur dire pourquoi il est là et semble en savoir beaucoup (trop) sur ses nouveaux élèves.
Bientôt, les enfants en sont persuadés, il a dû arriver quelque chose à madame Halfabet ! Aidée par la petite nouvelle, Riley, la bande se lance dans une enquête avec une seule idée en tête : sauver leur maîtresse…